针对坛紫菜传统养殖品种出现严重的种质退化，产量和品质下降，抗病能力降低等问题，该课题采用生物诱变和体细胞克隆等现代生物技术，开展了坛紫菜良种选育研究，并取得了重要进展。该课题于2002年正式启动，于2005年11月通过了科技部组织的课题验收。坛紫菜良种选育技术：通过人工诱变法获得坛紫菜的变异细胞，用生物工具酶将变异细胞单个分离并将其培养成完整叶状体。依据叶状体的主要光合色素和色素蛋白质含量的高低和它们相互间的比值，游离氨基酸含量高低，生长速度，藻体的厚薄和色泽等指标，筛选出优良叶状体，用酶解法再次获得它们的单个离体细胞，进行克隆再生培养。将获得的叶状体，单个培养至成熟叶状体，利用单性生殖获得纯系丝状体。丝状体的子1代叶状体的优良性状经遗传稳定性和综合品质分析后，对优良品系的纯系自由丝状体进行扩增培养，并移植于贝壳内使之成为贝壳丝状体。随后，用贝壳丝状体进行大田采苗和养殖试验。经大田试验证明为性状稳定的优良品系，以自由丝状体的方式进行长期保存和推广应用。该成果与传统紫菜大田良种选育技术相比，具良种选育速度快，选育面广，品系纯，优良性状稳定，良种保存和使用方便等优点。利用该成果，已成功地选育出20多个优良品系，其中的两个优良品系已在生产上推广养殖2000多亩。坛紫菜优良品系“申福1号”：该品系叶状体呈细长条状，藻体上下均称；颜色呈红褐绿色，光泽好，干品乌黑发亮；海区养殖形态和色泽高度一致；藻体平均厚度比传统品系减少11％以上，藻体更加柔软；叶绿素a、藻红蛋白和藻蓝蛋白三者的总量比传统品系增加29％以上。该品系生长速度快、成熟晚、生长期长(至少可收7水菜)，而传统品系在采收第1水菜时就已成熟，一水菜以后品质迅速下降，一般只能收3水菜。该品系各水菜的干品质量均优于传统品种，藻体柔软，口感好。第3水菜的蛋白质含量比传统品系提高12％左右。3年中试表明，“申福1号”第1水菜的产量比当地传统养殖品种增加25％-35％，第2至第5水菜增产30％以上。该品系已连续3年在福建、浙江和江苏三省十多个县市开展了中等规模的推广养殖。坛紫菜单性遗传纯系分离技术：该课题发现了坛紫菜存在单雌和单雄生殖现象。单雌或单雄生殖产生的丝状体其生长和发育均正常，由它们释散的壳孢子发育成形态和颜色高度一致的正常叶状体群体，性别全为单性，单雌生殖产生的丝状体的后代叶状体全部为雌性，单雄生殖产生的丝状体的后代叶状体全部为雄性。由单雌和单雄生殖产生的叶状体相互间可进行有性杂交，杂交后代发育正常、可育。表明，坛紫菜的雌雄叶状体均可行单性生殖，产生纯合的丝状体，后者产生的壳孢子发育成全雌或全雄的可育叶状体。该成果是分离坛紫菜遗传纯系的重要理论基础之一。坛紫菜单性栽培技术：通过单性生殖分别获得单雌或单雄的自由丝状体。单性自由丝状体纯系被无性克隆扩增后，被移植于贝壳内，获得贝壳丝状体。培育贝壳丝状体至成熟后，进行室内采苗和海上养殖。养殖结果：单雌自由丝状体的后代叶状体全部为雌性，而单雄自由丝状体的后代叶状体全部为雄性；单雌叶状体群体比单雄叶状体群体和传统雌雄混合养殖的叶状体群体的生长要快，成熟晚，生长期延长。另外，雌性叶状体比雄性叶状体大，再加上成熟变晚，单雌栽培的产量和质量比单雄栽培和雌雄混合栽培均有较大幅度的提高。单雌栽培克服了传统雌雄混合栽培引起的早成熟的雄性叶状体诱导雌性叶状体成熟，以及由于杂交引起的种质退化等不足点。利用坛紫菜单性栽培，可以确保良种的优良性状稳定地遗传下去，在生产上发挥较为稳定的增产效果，减少了良种需不断选育的麻烦。该成果开辟了新的坛紫菜养殖模式，技术新颖、简便，已成功地进行了多个坛紫菜优良品系的海上养殖试验，取得了很好的生产效果。该课题国内发表论著24篇、国外3篇；申请发明专利4项、获得发明专利授权1项；培养博士3名、硕士17名；成果创产值600万元、创利润200万元。